ويعتبر المصرى عبد العزيز سالم أول من ترأس الاتحاد الأفريقى من عام 1957 حتى 1958، وثانى رئيس مصرى أيضًا هو محمد عبد العزيز مصطفى من عام 1958 حتى 1968.
ترأس السودانى عبد الحليم محمد الكاف فى الفترة من 1968 إلى 1972.
تولى الأثيوبى يدنكاتشيو تسيما الاتحاد فى الفترة من 1972 حتى 1987.
عادت السودان إلى رئاسة الاتحاد الافريقي عن طريق عبد الحليم محمد مرة أخرى من عام 1987 حتى 1988.
تواجد الكاميروني عيسى حياتو من 1988 حتى عام 2017.
تواجد الملغاشى أحمد أحمد من عام 2017 حتى الأن.